1、代理記賬機構設立不規范
新辦法明確規定，代理記賬機構必須有三名以上的專職會計從業人員持有會計資格證書，會計業務負責人必須具有會計師專業以上職稱。許多機構還存在著非法就業、注冊員工、人員配備不足、代理記賬業務負責人資格不足等問題。
2、合法記賬機構離不開行政許可
目前，代理行業中有個別“代理記賬公司”不具備代理記賬資質(市財政局批準的代理記賬許可證、會計上崗證等)，發生問題后回避責任，損害客戶利益。
3、業務狹窄，服務種類少
代理記賬機構越來越多，但規模普遍較小，業務范圍不廣。很少有機構能夠真正為客戶提供會計、稅務籌劃、納稅申報、內部審計、工商稅務登記年檢、財稅咨詢等全面的會計服務。
4、專業知識較低，執業質量不樂觀
一些代理記賬機構的執業質量不樂觀，實際操作人員的專業會計技能水平普遍較低，導致代理記賬基礎工作普遍薄弱。會計方面也有許多不規范之處。“代理記賬”的措施不得力，甚至出現許多“代理記賬員”不具備合法資格的情況。
選擇一個正式的代理記賬公司是非常重要的，因為不規范的代理記賬或個人代理經常會出現一些財務問題，導致稅收罰款或其他不負責任的行為。
而正規代理記賬公司將簽訂一份非常正式的合同協議，完全按照合同的規定辦事，具體事項可以在幾天內完成，幾乎沒有延誤，工作效率高，工作負責。即使代理記賬公司出現財務問題，也要主動承擔責任。當然，專業的代理記賬公司非常專業，而且出錯的概率很小。
以下是對劣質代理人會計所造成的危害的簡要介紹：
劣質代理記賬的危害
1、在收集會計信息時，不會向您提供收據。
2、在申報稅額前，將不予通知。
3、提供納稅申報表，不提供賬戶。不提供賬本。
4、沒有專人匯報報稅、做賬進度和情況。
5、銀行不錄入賬戶，憑證無附件。
6、終止代理記賬以后不提供記賬憑證。
7、不簽署正式的代理記賬合同是不負責任的。
專業服務標準
1、順豐郵寄收單。安全可靠。
2、稅收籌劃及技巧指導。
3、代打銀行對賬單。
4、整理原始憑證。
5、用友專業版本軟件記賬。
6、一個會計記賬，兩個主管核對賬目。誤差率非常小。
7、納稅申報。
8、網上代為開具發票。
9、會計資料由專人保管，保密工作到位。
10、如錯報漏報，承擔全部損失。