1.銷售額控制不同：小規模納稅人連續12個月銷售額不能超過最高額度，超過后應轉為一般納稅人;一般納稅人的銷售額沒有限額。（小規模年應征增值稅銷售額≤500萬元，一般納稅人年應征增值稅銷售額＞500萬元）
2.增值稅稅率不同：小規模納稅人除出租、出售不動產征收率5%，銷售使用過的固定資產征收率2%，以及免稅產品以外，其他都是3%;一般納稅人增值稅稅率分別是6%、9%、13%三檔稅率。
3.增值稅計算方式不同：小規模納稅人應交增值稅=含稅價÷(1+征收率)×征收率; 一般納稅人應交增值稅=銷項稅-進項稅。
4.開具增值稅發票不同：部分小規模納稅人不能自行開具增值稅專用發票或月銷售額超過10萬才能自行開具專票;一般納稅人既能開具增值稅專用發票，也能開具增值稅普通發票;
5.增值稅優惠政策不同：小規模納稅人季度銷售額≤30萬元，免征增值稅及附征稅，一般納稅人沒有此項優惠。
6.申報期限不同：小規模納稅人增值稅及附征稅按季申報，一般納稅人增值稅及附征稅按月申報。
7.小規模納稅人雖然不能自行開具增值稅專用發票，但可以向稅務局申請代開增值稅專用發票，而一般納稅人不能向稅局申請代開。