申請軟件著作權作用主要有以下幾點：
1、固化權利，在著作權被侵犯時便于獲得保護
對于軟著權人而言，若其軟件在推出市場后遭遇大量的盜版等不法侵害，其主張權利保護的基礎即其享有該軟件的著作權，從而可以申請工商查處該盜版商，或通過民事訴訟來主張著作權侵權，保護其合法享有的知識產權不受侵犯。
2、軟件產品退稅
根據財政部財稅【2011】100號文件，完成軟件著作權登記和軟件產品登記測試后，增值稅一般納稅人銷售其自行開發生產的軟件產品，按17%或6%稅率征收增值稅后，對其增值稅實際稅負超過3%的部分實行即征即退政策。經主管機關審核批準，可以享受本增值稅政策。可見，一個很大的作用是可以享受退稅政策，這對于很多軟件企業而言，是一筆很可觀的稅收優惠。
3、企業資質的申請
著作權作為知識產權的一種，是企業技術實力的一種象征。在企業申請高新技術企業認證或雙軟企業時，軟件著作權的數量是證明其技術實力的重要依據。因此，為滿足申請企業資質的需要，對軟件著作權進行登記也是很有必要的。